Činnost laboratoře se orientuje na rozbory složek životního a pracovního prostředí (rozbory vod, odpadů, zemin, sedimentů, kalů, ovzduší, potravin, kosmetiky, krmiv), kontrolu sterilizátorů, kontrolu mikrobiální čistoty prostředí a také na interpretaci výsledků a hledání nápravných opatření.